Himpunan reaksi sintesis biologis disebut pertukaran plastik, atau asimilasi. Nama jenis pertukaran ini mencerminkan esensinya: dari zat sederhana yang masuk ke dalam sel dari luar, terbentuklah zat yang mirip dengan zat sel.
Mari kita pertimbangkan salah satu bentuk metabolisme plastik yang paling penting - biosintesis protein. Seluruh variasi sifat protein pada akhirnya ditentukan oleh struktur primer, yaitu urutan asam amino. Sejumlah besar kombinasi unik asam amino yang dipilih secara evolusi direproduksi melalui sintesis asam nukleat dengan rangkaian basa nitrogen yang sesuai dengan urutan asam amino dalam protein. Setiap asam amino dalam rantai polipeptida berhubungan dengan kombinasi tiga nukleotida - triplet.
Proses penerapan informasi herediter dalam biosintesis dilakukan dengan partisipasi tiga jenis asam ribonukleat: informasi (templat) - mRNA (mRNA), ribosom - rRNA dan transportasi - tRNA. Semua asam ribonukleat disintesis di bagian molekul DNA yang sesuai. Ukurannya jauh lebih kecil daripada DNA dan mewakili rantai nukleotida tunggal. Nukleotida mengandung residu asam fosfat (fosfat), gula pentosa (ribosa) dan salah satu dari empat basa nitrogen - adenin, sitosin, guanin, dan urasil. Basa nitrogen, urasil, bersifat komplementer dengan adenin.
Proses biosintesis rumit dan mencakup sejumlah tahapan - transkripsi, penyambungan, dan translasi.
Tahap pertama (transkripsi) terjadi di inti sel: mRNA disintesis di bagian gen tertentu pada molekul DNA. Sintesis ini dilakukan dengan partisipasi kompleks enzim, yang utamanya adalah RNA polimerase yang bergantung pada DNA, yang menempel pada titik awal molekul DNA, melepaskan heliks ganda dan, bergerak sepanjang salah satu untaian, mensintesis untaian mRNA komplementer di sebelahnya. Sebagai hasil transkripsi, mRNA mengandung informasi genetik dalam bentuk pergantian nukleotida yang berurutan, yang urutannya disalin secara tepat dari bagian (gen) molekul DNA yang sesuai.
Penelitian lebih lanjut menunjukkan bahwa selama proses transkripsi, apa yang disebut pro-mRNA disintesis - prekursor mRNA matang yang terlibat dalam penerjemahan. Pro-mRNA memiliki efek yang signifikan ukuran besar dan mengandung fragmen yang tidak mengkode sintesis rantai polipeptida yang sesuai. Dalam DNA, bersama dengan daerah yang mengkode rRNA, tRNA, dan polipeptida, terdapat fragmen yang tidak mengandung informasi genetik. Mereka disebut intron, berbeda dengan fragmen pengkode yang disebut ekson. Intron ditemukan di banyak bagian molekul DNA. Misalnya, satu gen, bagian DNA yang mengkode ovalbumin ayam, mengandung 7 intron, dan gen albumin serum tikus mengandung 13 intron. Panjang intron bervariasi - dari dua ratus hingga seribu pasang nukleotida DNA. Intron dibaca (ditranskripsi) bersamaan dengan ekson, sehingga pro-mRNA jauh lebih panjang dibandingkan mRNA matang. Di dalam nukleus, intron dipotong menjadi pro-mRNA oleh enzim khusus, dan fragmen ekson “disambung” menjadi satu dalam urutan yang ketat. Proses ini disebut penyambungan. Selama proses penyambungan, mRNA matang terbentuk, yang hanya berisi informasi yang diperlukan untuk sintesis polipeptida yang sesuai, yaitu bagian informatif dari gen struktural.
Arti dan fungsi intron masih belum sepenuhnya jelas, namun diketahui bahwa jika hanya bagian ekson yang dibaca dalam DNA, mRNA matang tidak akan terbentuk. Proses penyambungan dipelajari dengan menggunakan contoh gen ovalbumin. Ini berisi satu ekson dan 7 intron. Pertama, pro-mRNA yang mengandung 7700 nukleotida disintesis pada DNA. Kemudian pada pro-mRNA jumlah nukleotida berkurang menjadi 6800, kemudian menjadi 5600, 4850, 3800, 3400, dst hingga 1372 nukleotida yang sesuai dengan ekson. Mengandung 1372 nukleotida, mRNA meninggalkan nukleus menuju sitoplasma, memasuki ribosom dan mensintesis polipeptida yang sesuai.
Tahap biosintesis selanjutnya - translasi - terjadi di sitoplasma pada ribosom dengan partisipasi tRNA.
RNA transfer disintesis di dalam nukleus, tetapi berfungsi dalam keadaan bebas di sitoplasma sel. Satu molekul tRNA mengandung 76-85 nukleotida dan memiliki struktur yang agak rumit, mengingatkan pada daun semanggi. Tiga bagian tRNA yang sangat penting: 1) antikodon, terdiri dari tiga nukleotida, yang menentukan tempat perlekatan tRNA ke kodon komplementer (mRNA) yang sesuai pada ribosom; 2) wilayah yang menentukan kekhususan tRNA, kemampuan molekul tertentu untuk menempel hanya pada asam amino tertentu; 3) tempat akseptor tempat melekatnya asam amino. Ini sama untuk semua tRNA dan terdiri dari tiga nukleotida - C-C-A. Penambahan asam amino ke tRNA didahului dengan aktivasi oleh enzim aminoasil-tRNA sintetase. Enzim ini spesifik untuk setiap asam amino. Asam amino yang diaktifkan melekat pada tRNA yang sesuai dan dikirim ke ribosom.
Tempat sentral dalam penerjemahan adalah milik ribosom - organel ribonukleoprotein sitoplasma, yang terdapat dalam jumlah besar di dalamnya. Ukuran ribosom pada prokariota rata-rata 30x30x20 nm, pada eukariota - 40x40x20 nm. Biasanya ukurannya ditentukan dalam satuan sedimentasi (S) - laju sedimentasi selama sentrifugasi dalam media yang sesuai. Pada bakteri Escherichia coli, ribosom berukuran 70S dan terdiri dari dua subunit, salah satunya memiliki konstanta 30S, yang kedua 50S, dan mengandung 64% RNA ribosom dan 36% protein.
Molekul mRNA meninggalkan nukleus menuju sitoplasma dan menempel pada subunit ribosom kecil. Penerjemahan dimulai dengan apa yang disebut kodon awal (pemrakarsa sintesis) - A-U-G-. Ketika tRNA mengantarkan asam amino teraktivasi ke ribosom, antikodonnya adalah ikatan hidrogen dengan nukleotida kodon komplementer mRNA. Ujung akseptor tRNA dengan asam amino yang sesuai melekat pada permukaan subunit ribosom besar. Setelah asam amino pertama, tRNA lain mengirimkan asam amino berikutnya, dan dengan demikian rantai polipeptida disintesis pada ribosom. Molekul mRNA biasanya bekerja pada beberapa (5-20) ribosom sekaligus, dihubungkan menjadi polisom. Awal sintesis rantai polipeptida disebut inisiasi, pertumbuhannya disebut pemanjangan. Urutan asam amino dalam rantai polipeptida ditentukan oleh urutan kodon pada mRNA. Sintesis rantai polipeptida berhenti ketika salah satu kodon terminator muncul pada mRNA - UAA, UAG atau UGA. Akhir dari sintesis rantai polipeptida tertentu disebut terminasi.
Telah ditetapkan bahwa dalam sel hewan, rantai polipeptida memanjang sebanyak 7 asam amino dalam satu detik, dan mRNA maju ke ribosom sebanyak 21 nukleotida. Pada bakteri, proses ini terjadi dua hingga tiga kali lebih cepat.
Akibatnya, sintesis struktur utama molekul protein - rantai polipeptida - terjadi pada ribosom sesuai dengan urutan pergantian nukleotida dalam templat asam ribonukleat - mRNA. Itu tidak bergantung pada struktur ribosom.
Garis besar pelajaran
: “Sintesis protein dalam sel”(Untuk kelas 10 khusus, waktu pelajaran - 2 jam)
Guru: Mastyukhina Anna Aleksandrovna
Institusi pendidikan kota "Sekolah menengah dinamai Jenderal Zakharkin I.G."
Tujuan pelajaran:
Pendidikan:
belajarfitur biosintesis protein dalam sel, mempelajari konsep:gen, kode genetik, triplet, kodon, antikodon, transkripsi, translasi, polisom; Pterus mengembangkan pengetahuan tentang mekanisme biosintesis protein pada contoh translasi; mengetahui peran RNA transfer dalam proses biosintesis protein; mengungkap mekanisme sintesis templat rantai polipeptida pada ribosom.Pembangunan:
untuk mengembangkan minat kognitif siswapersiapkan pesan terlebih dahulu(« Fakta Menarik tentang gen", "Kode genetik", "Transkripsi dan terjemahan"). Untuk mengembangkan keterampilan praktisakan membuat sinkronisasi. Untuk mengembangkan pemikiran logisbelajar memecahkan masalah.Pendidikan:
Untuk membentuk pandangan ilmiah, membuktikan pentingnya dan pentingnya sintesis protein dalam sel, serta kebutuhan vitalnya.EMPAT
.: pelajaran.Jenis pelajaran
: digabungkanJenis pelajaran
: dengan presentasi “Sintesis protein dalam sel” dan demonstrasi model magnetik.Peralatan:
presentasi “Sintesis protein dalam sel”; tabel "Kode genetik"; Skema “Pembentukan mRNA dari cetakan DNA (transkripsi)”; Skema “Struktur t-RNA”; Skema “Sintesis protein dalam ribosom (terjemahan)”; Skema “Sintesis protein pada polisom”; Kartu tugas dan teka-teki silang; model magnetik.Selama kelas:
Metode dan teknik metodologis:
SAYA
.Organisasi kelas.Pada pelajaran sebelumnya kita telah mempelajari zat yang disebut asam nukleat. Karena
kemudian kita melihat dua jenisnya: DNA dan RNA, serta mengenal struktur dan fungsinya. Ditemukan bahwa masing-masing asam nukleat mengandung empat basa nitrogen berbeda, yang terhubung satu sama lain berdasarkan prinsip saling melengkapi. Semua pengetahuan ini akan kita butuhkan ketika mempelajari topik baru hari ini.
Jadi tuliskan namanya di buku kerja Anda “Sintesis protein dalam sel.”II
.Mempelajari materi baru:1) Memperbarui pengetahuan:
Sebelum mulai mempelajari topik baru, mari kita ingat kembali: apa itu metabolisme (metabolisme):
METABOLISME - totalitas semua reaksi enzimatik sel, yang berhubungan satu sama lain dan dengan lingkungan luar, terdiri dari plastik
dan pertukaran energi.
Mari kita membuat syncwine, kata pertama adalah metabolisme.
(1-metabolisme2-plastik, energi
3-mengalir, menyerap, melepaskan
4 set reaksi enzimatik sel
5-metabolisme)
Biosintesis protein
mengacu pada reaksi pertukaran plastik. Biosintesis protein – proses terpenting dalam kehidupan alam. Ini adalah penciptaan molekul protein berdasarkan informasi tentang urutan asam amino dalam struktur utamanya yang terkandung dalam struktur DNATugas: melengkapi kalimat dengan mengisi suku-suku yang hilang.
1. Fotosintesis adalah...
(sintesis zat organik dalam cahaya).2. Proses fotosintesis dilakukan pada organel sel - ...
(kloroplas).3. Oksigen bebas dilepaskan selama fotosintesis selama penguraian...
(air).4. Pada tahap fotosintesis manakah oksigen bebas terbentuk? Di…
(lampu).5. Selama tahap ringan... ATP.
(Disintesis.)6. Pada tahap gelap, kloroplas menghasilkan...
(Karbohidrat utama adalah glukosa).7. Saat matahari menyinari klorofil...
(eksitasi elektron).8. Fotosintesis terjadi di dalam sel...
(tanaman hijau).9. Fase terang fotosintesis terjadi di...
(tilakoid).10. Fase gelap terjadi di...
(setiap) Waktu dalam Sehari.Proses asimilasi yang paling penting dalam sel adalah
protein bawaannya.Setiap sel mengandung ribuan protein, termasuk protein unik spesies ini sel. Karena semua protein cepat atau lambat hancur dalam proses kehidupan, sel harus terus mensintesis protein untuk memulihkannya
, organel, dll. Selain itu, banyak sel yang “memproduksi” protein untuk kebutuhan seluruh organisme, misalnya sel kelenjar endokrin, yang mengeluarkan hormon protein ke dalam darah. Dalam sel-sel seperti itu, sintesis protein sangat intensif.2)Mempelajari materi baru:
Sintesis protein memerlukan banyak energi.
Sumber energi ini, seperti halnya semua proses seluler, adalah
. Keragaman fungsi protein ditentukan oleh struktur utamanya, yaitu. urutan asam amino dalam molekulnya. Pada gilirannya, turun temurun Struktur utama suatu protein terkandung dalam urutan nukleotida dalam molekul DNA. Bagian DNA yang berisi informasi tentang struktur primer suatu protein disebut gen. Satu kromosom berisi informasi tentang struktur ratusan protein.
Kode genetik.
Setiap asam amino dalam protein
sesuai dengan urutan tiga nukleotida yang terletak satu demi satu - triplet. Sampai saat ini, peta kode genetik telah disusun, yaitu diketahui kombinasi triplet nukleotida DNA mana yang sesuai dengan satu atau beberapa dari 20 asam amino penyusun protein (Gbr. 33). Seperti yang Anda ketahui, DNA dapat mengandung empat basa nitrogen: adenin (A), guanin (G), timin (T) dan sitosin (C). Banyaknya kombinasi 4 dengan 3 adalah: 43 = 64, yaitu 64 asam amino berbeda yang dapat dikodekan, sedangkan hanya 20 asam amino yang dapat dikodekan. Ternyata banyak asam amino tidak hanya berhubungan dengan satu, tetapi beberapa kembar tiga - kodon yang berbeda.Diasumsikan bahwa sifat kode genetik ini meningkatkan keandalan penyimpanan dan transmisi informasi genetik selama pembelahan sel. Misalnya, asam amino alanin berhubungan dengan 4 kodon: CGA, CGG, CTG, CGC, dan ternyata kesalahan acak pada nukleotida ketiga tidak dapat mempengaruhi struktur protein - itu akan tetap menjadi kodon alanin.
Karena molekul DNA mengandung ratusan gen, molekul tersebut tentu mengandung kembar tiga, yang merupakan “tanda baca” dan menunjukkan awal dan akhir gen tertentu.
Sifat yang sangat penting dari kode genetik adalah spesifisitas, yaitu satu triplet selalu hanya mewakili satu asam amino. Kode genetik bersifat universal untuk semua organisme hidup mulai dari bakteri hingga manusia.
Transkripsi. Pembawa semua informasi genetik adalah DNA yang terletak di
Sitoplasma harus mengandung sekumpulan asam amino yang diperlukan untuk sintesis protein. Asam amino ini terbentuk sebagai hasil pemecahan protein makanan. Selain itu, asam amino tertentu dapat mencapai tempat sintesis protein langsung, yaitu ribosom, hanya dengan menempel pada RNA transfer khusus (tRNA).
Transfer RNA.
Untuk mentransfer setiap jenis asam amino ke ribosom, diperlukan jenis tRNA yang terpisah. Karena protein mengandung sekitar 20 asam amino, jenis tRNA juga banyak. Struktur semua tRNA serupa (Gbr. 35). Molekulnya membentuk struktur aneh yang bentuknya menyerupai daun semanggi. Jenis tRNA tentu berbeda dalam triplet nukleotida yang terletak “di atas”. Triplet ini, yang disebut antikodon, memiliki kode genetik yang sesuai dengan asam amino yang akan dibawa oleh T-RNA ini. Suatu enzim khusus harus melekat pada “tangkai daun” asam amino yang dikodekan oleh triplet yang melengkapi antikodon.
Siaran.
Tahap terakhir sintesis protein—translasi—terjadi di sitoplasma. Ribosom dipasang pada ujung mRNA tempat sintesis protein harus dimulai (Gbr. 36). Ribosom bergerak di sepanjang molekul mRNA secara terputus-putus, dalam bentuk “lompatan”, tetap pada setiap triplet selama kurang lebih 0,2 detik. Pada saat ini, satu dari banyak tRNA mampu “mengidentifikasi” triplet tempat ribosom berada dengan antikodonnya. Dan jika antikodon melengkapi triplet mRNA ini, asam amino dilepaskan dari “tangkai daun” dan diikat melalui ikatan peptida ke rantai protein yang sedang tumbuh (Gbr. 37). Pada saat ini, ribosom bergerak sepanjang mRNA ke triplet berikutnya, mengkode asam amino berikutnya dari protein yang disintesis, dan t-RNA berikutnya “membawa” asam amino yang diperlukan, yang meningkatkan pertumbuhan rantai protein. Operasi ini diulangi sebanyak jumlah asam amino yang harus dikandung oleh protein yang sedang dibangun. Jika terdapat satu set kembar tiga di ribosom, yang merupakan “sinyal berhenti” antar gen, maka tidak ada satu pun t-RNA yang dapat bergabung dengan triplet tersebut, karena t-RNA tidak memiliki antikodon untuk mereka. Pada titik ini, sintesis protein berakhir. Semua reaksi yang dijelaskan terjadi dalam periode waktu yang sangat singkat. Diperkirakan sintesis molekul protein yang cukup besar hanya membutuhkan waktu sekitar dua menit.
Sebuah sel tidak membutuhkan satu, tetapi banyak molekul dari setiap protein. Oleh karena itu, segera setelah ribosom, yang pertama memulai sintesis protein pada mRNA, bergerak maju, ribosom kedua yang mensintesis protein yang sama berada di belakangnya pada mRNA yang sama. Kemudian ribosom ketiga, keempat, dan seterusnya dirangkai secara berurutan pada mRNA.Semua ribosom yang mensintesis protein yang sama yang dikodekan dalam mRNA tertentu disebut polisom.
Ketika sintesis protein selesai, ribosom dapat menemukan mRNA lain dan mulai mensintesis protein yang strukturnya dikodekan dalam mRNA baru.
Jadi, translasi adalah translasi rangkaian nukleotida molekul mRNA menjadi rangkaian asam amino dari protein yang disintesis.
Diperkirakan seluruh protein dalam tubuh mamalia hanya dapat dikodekan oleh dua persen DNA yang terkandung dalam selnya. Untuk apa 98% DNA lainnya dibutuhkan? Ternyata setiap gen jauh lebih kompleks dari yang diperkirakan sebelumnya, dan tidak hanya berisi bagian di mana struktur protein dikodekan, tetapi juga bagian khusus yang dapat “menghidupkan” atau “mematikan” kerja setiap gen. . Inilah sebabnya mengapa semua sel, misalnya tubuh manusia Memiliki kumpulan kromosom yang sama, mereka mampu mensintesis protein yang berbeda: di beberapa sel, sintesis protein terjadi dengan bantuan gen tertentu, sementara di sel lain, gen yang sama sekali berbeda terlibat. Jadi, di setiap sel hanya sebagian informasi genetik yang terkandung di dalam gennya yang diwujudkan.
Sintesis protein memerlukan partisipasi sejumlah besar enzim. Dan setiap reaksi sintesis protein memerlukan enzim khusus.
IV
.Amankan materi:Isi tabel:
DALAM 1
Biosintesis protein terdiri dari dua tahap berturut-turut: transkripsi dan translasi.
Selesaikan masalah 1:
Antikodon tRNA yang diberikan: GAA, GCA, AAA, ACG. Dengan menggunakan tabel kode genetik, tentukan urutan asam amino dalam molekul protein, kodon mRNA dan kembar tiga pada fragmen gen yang mengkode protein tersebut.
Larutan:
kodon mRNA: TSUU – TsGU – UUU – UGC.
Urutan asam amino: leu – arg – phen – cis.
Kembar tiga DNA: GAA – GCA – AAA – ACG.
Tugas 2
TGT-ATSA-TTA-AAA-CCT. Tentukan urutan nukleotida mRNA dan urutan asam amino dalam protein yang disintesis di bawah kendali gen ini.
Jawaban: DNA: TGT-ATSA-TTA-AAA-CCT
mRNA: ACA-UGU-AAU-UUU-GGA
Protein: tre---cis---asp---fen---gli.
PADA 2
Selesaikan masalah 1:
Diberikan adalah fragmen molekul DNA beruntai ganda. Dengan menggunakan tabel kode genetik, tentukan struktur fragmen molekul protein yang dikodekan oleh bagian DNA ini:
AAA – TTT – YYY – CCC
TTT – AAA – TCC – YYY.
Larutan:
Karena mRNA selalu disintesis hanya pada satu untai DNA, yang biasanya digambarkan secara tertulis sebagai untai teratas
mRNA: UUU – AAA – CCC – YGG;
fragmen protein dikodekan rantai atas: pengering rambut - liz - pro - gly.
Tugas 2
: bagian DNA memiliki urutan nukleotida berikut:TGT-ATSA-TTA-AAA-CCT. Tentukan urutan nukleotida mRNA dan urutan asam amino dalam protein yang disintesis di bawah kendali gen ini.
Jawaban: DNA: AGG-CCT-TAT-YYY-CGA
mRNA: UCC-GGA-AUA-CCC-GCU
Protein: ser---gli---iso---pro---ala
Sekarang mari kita simak pesan menarik yang telah Anda siapkan.
"Fakta menarik tentang gen"
"Kode genetik"
"Transkripsi dan Penyiaran"
VI
.Menyimpulkan pelajaran.1) Kesimpulan dari pelajaran:
Salah satu proses terpenting yang terjadi dalam sel adalah sintesis protein. Setiap sel mengandung ribuan protein, termasuk yang unik untuk jenis sel tersebut. Karena dalam proses kehidupan, semua protein cepat atau lambatdihancurkan, sel harus terus menerus mensintesis protein untuk memulihkan membran, organel, dll. Selain itu, banyak sel yang memproduksi protein untuk kebutuhan seluruh organisme, misalnya sel kelenjar endokrin, yang mengeluarkan hormon protein ke dalam darah. Dalam sel-sel seperti itu, sintesis protein sangat intensif. Sintesis protein memerlukan banyak energi. Sumber energi ini, seperti halnya semua proses seluler, adalah ATP.2) Nilai pekerjaan mandiri siswa dan pekerjaannya di papan tulis. Evaluasi juga aktivitas peserta percakapan dan pembicara.
V
II . Pekerjaan rumah:Ulangi § 2.13.
Pecahkan teka-teki silang:
1. Urutan nukleotida tertentu yang terletak di awal setiap gen.
2. Transisi rangkaian nukleotida molekul mRNA menjadi rangkaian AK molekul protein.
3. Tanda mulai siaran.
4. Pembawa informasi genetik yang terletak di dalam inti sel.
5. Properti kode genetik yang meningkatkan keandalan penyimpanan dan transmisi informasi genetik selama pembelahan sel.
6. Bagian DNA yang berisi informasi tentang struktur primer suatu protein.
7. Urutan tiga nukleotida DNA yang terletak satu demi satu.
8. Semua ribosom yang mensintesis protein pada satu molekul mRNA.
9. Proses penerjemahan informasi urutan AK dalam suatu protein dari “bahasa DNA” ke “bahasa RNA”.
10. Kodon yang tidak mengkode AK, tetapi hanya menunjukkan bahwa sintesis protein harus diselesaikan.
11. Struktur, dimana ditentukan urutan AK dalam suatu molekul protein.
12. Properti penting kode genetik, yang terdiri dari fakta bahwa satu triplet selalu mengkodekan hanya satu AK.
13. Sebuah “tanda baca” pada molekul DNA yang menunjukkan bahwa sintesis mRNA harus dihentikan.
14. Kode genetik... untuk semua makhluk hidup mulai dari bakteri hingga manusia.
- hingga 2 menit
- pidato pengantar guru
-35 menit
-10 menit
-guru
-1 siswa di dewan
-siswa menulis di buku catatan
-guru
- dari suatu tempat
-geser 1 dan 2
-geser 3
-geser 4
-geser 5
-geser 6
-geser 7 dan 8
-geser 9 dan 10
-geser 11 dan 12
-geser 13
-geser 14
-geser 15 dan 16
-geser 17 dan 18
-geser 19 dan 20
-transisi logis
-geser 21
-guru
-25 menit
-guru
-guru
-geser 22
-guru
-geser 23
-geser 24
-geser 25
-15 menit
geser 27
-grup No.1
- secara individual pada kartu
-grup No.2
- secara individual pada kartu
-30 menit
-siap
-geser 29
-10 menit (1 pelajaran)
-10 menit (2 pelajaran)
-10 menit (3 pelajaran)
-5 menit
-guru
-3 menit
-geser 30
-di kartu
Biosintesis protein terjadi di setiap sel hidup. Ini paling aktif di sel muda yang sedang tumbuh, tempat protein disintesis untuk membangun organelnya, serta di sel sekretori, tempat protein enzim dan protein hormon disintesis.
Peran utama dalam menentukan struktur protein adalah milik DNA. Sepotong DNA yang berisi informasi tentang struktur suatu protein disebut gen. Sebuah molekul DNA mengandung beberapa ratus gen. Molekul DNA mengandung kode urutan asam amino dalam suatu protein dalam bentuk gabungan nukleotida tertentu. Kode DNA hampir sepenuhnya diuraikan. Esensinya adalah sebagai berikut. Setiap asam amino berhubungan dengan bagian rantai DNA yang terdiri dari tiga nukleotida yang berdekatan.
Misalnya, bagian T-T-T berhubungan dengan asam amino lisin, bagian A-C-A berhubungan dengan sistin, C-A-A dengan valin, dll. Ada 20 asam amino yang berbeda, banyak kemungkinan kombinasi 4 nukleotida dari 3 adalah 64. Oleh karena itu, kembar tiga adalah cukup melimpah untuk mengkode semua asam amino.
Sintesis protein adalah proses multi-tahap yang kompleks, mewakili rantai reaksi sintetik yang berlangsung sesuai dengan prinsip sintesis matriks.
Karena DNA terletak di inti sel, dan sintesis protein terjadi di sitoplasma, terdapat perantara yang mentransfer informasi dari DNA ke ribosom. Utusan ini adalah mRNA. :
Dalam biosintesis protein, tahapan berikut ditentukan, terjadi di bagian yang berbeda sel:
1. Tahap pertama - sintesis i-RNA terjadi di dalam nukleus, di mana informasi yang terkandung dalam gen DNA ditulis ulang menjadi i-RNA. Proses ini disebut transkripsi (dari bahasa Latin “transkrip” - penulisan ulang).
2. Pada tahap kedua, asam amino digabungkan dengan molekul tRNA, yang secara berurutan terdiri dari tiga nukleotida - antikodon, yang dengannya kodon tripletnya ditentukan.
3. Tahap ketiga adalah proses sintesis langsung ikatan polipeptida yang disebut translasi. Itu terjadi di ribosom.
4. Pada tahap keempat terjadi pembentukan struktur protein sekunder dan tersier, yaitu pembentukan struktur akhir protein.
Dengan demikian, dalam proses biosintesis protein, terbentuk molekul protein baru sesuai dengan informasi pasti yang terkandung dalam DNA. Proses ini menjamin pembaharuan protein, proses metabolisme, pertumbuhan dan perkembangan sel, yaitu seluruh proses kehidupan sel.
Kromosom (dari bahasa Yunani "chroma" - warna, "soma" - tubuh) adalah struktur inti sel yang sangat penting. bermain Pemeran utama selama pembelahan sel, memastikan transmisi informasi turun-temurun dari satu generasi ke generasi lainnya. Mereka adalah untaian tipis DNA yang terkait dengan protein. Untaian tersebut disebut kromatid, terdiri dari DNA, protein basa (histon), dan protein asam.
Dalam sel yang tidak membelah, kromosom mengisi seluruh volume inti dan tidak terlihat di bawah mikroskop. Sebelum pembelahan dimulai, spiralisasi DNA terjadi dan setiap kromosom terlihat di bawah mikroskop. Selama spiralisasi, kromosom memendek puluhan ribu kali lipat. Dalam keadaan ini, kromosom tampak seperti dua untaian identik (kromatid) yang terletak bersebelahan, dihubungkan oleh bagian yang sama - sentromer.
Setiap organisme dicirikan oleh jumlah dan struktur kromosom yang konstan. Pada sel somatik kromosom selalu berpasangan, yaitu di dalam nukleus terdapat dua kromosom identik yang membentuk satu pasang. Kromosom seperti itu disebut homolog, dan kumpulan kromosom berpasangan dalam sel somatik disebut diploid.
Jadi, kumpulan kromosom diploid pada manusia terdiri dari 46 kromosom sehingga membentuk 23 pasang. Setiap pasangan terdiri dari dua kromosom identik (homolog).
Ciri-ciri struktur kromosom memungkinkan untuk membedakannya menjadi 7 kelompok, yang ditandai dengan huruf latin A, B, C, D, E, F, G. Semua pasangan kromosom mempunyai nomor urut.
Pria dan wanita memiliki 22 pasang kromosom yang identik. Mereka disebut autosom. Seorang pria dan seorang wanita berbeda dalam satu pasang kromosom, yang disebut kromosom seks. Mereka ditandai dengan huruf - X besar (grup C) dan Y kecil (grup C). Pada tubuh wanita terdapat 22 pasang autosom dan satu pasang (XX) kromosom seks. Pria memiliki 22 pasang autosom dan satu pasang (XY) kromosom seks.
Berbeda dengan sel somatik, sel germinal mengandung setengah set kromosom, yaitu mengandung satu kromosom dari setiap pasangan! Himpunan ini disebut haploid. Kumpulan kromosom haploid muncul selama pematangan sel.
Tupai sangat bermain peran penting dalam kehidupan organisme, melakukan fungsi pelindung, struktural, hormonal, dan energi. Memastikan pertumbuhan otot dan jaringan tulang. Protein memberikan informasi tentang struktur sel, fungsi dan sifat biokimianya, serta merupakan bagian yang berharga, bermanfaat bagi tubuh produk makanan (telur, produk susu, ikan, kacang-kacangan, polong-polongan, gandum hitam dan gandum). Kecernaan makanan tersebut dijelaskan oleh nilai biologisnya. Dengan jumlah protein yang sama, produk yang nilainya lebih tinggi akan lebih mudah dicerna. Polimer yang rusak harus dikeluarkan dari tubuh dan diganti dengan yang baru. Proses ini terjadi selama sintesis protein dalam sel.
Apa itu protein?
Zat yang hanya terdiri dari residu asam amino disebut protein sederhana (protein). Jika perlu, gunakanlah properti energik, sehingga orang yang menjalani gaya hidup sehat seringkali membutuhkan tambahan asupan protein. Protein kompleks, proteid, mengandung protein sederhana dan bagian non-protein. Sepuluh asam amino dalam protein bersifat esensial, artinya tubuh tidak dapat mensintesisnya sendiri, berasal dari makanan, sedangkan sepuluh lainnya dapat diganti, yaitu dapat dibuat dari asam amino lain. Dari sinilah proses penting bagi semua organisme dimulai.
Tahapan utama biosintesis: dari mana asal protein?
Molekul baru diambil sebagai hasil biosintesis - reaksi kimia koneksi. Ada dua tahap utama sintesis protein dalam sel. Ini adalah transkripsi dan siaran. Transkripsi terjadi di dalam nukleus. Ini adalah pembacaan dari DNA (asam deoksiribonukleat), yang membawa informasi tentang protein masa depan, ke RNA (asam ribonukleat), yang mentransfer informasi ini dari DNA ke sitoplasma. Hal ini terjadi karena DNA tidak terlibat langsung dalam biosintesis, hanya membawa informasi, tidak mampu memasuki sitoplasma tempat sintesis protein, dan hanya berfungsi sebagai pembawa informasi genetik. Transkripsi memungkinkan Anda membaca data dari templat DNA menjadi RNA sesuai dengan prinsip saling melengkapi.
Peran RNA dan DNA dalam proses tersebut
Jadi, sintesis protein dalam sel dipicu oleh rantai DNA yang membawa informasi tentang protein tertentu dan disebut gen. Rantai DNA terlepas selama transkripsi, yaitu heliksnya mulai terurai menjadi molekul linier. Dari DNA, informasi harus diubah menjadi RNA. Dalam proses ini, adenin seharusnya menjadi timin yang berlawanan. Sitosin memiliki pasangan guanin, sama seperti DNA. Berlawanan dengan adenin, RNA menjadi urasil, karena dalam RNA tidak ada nukleotida seperti timin, ia hanya digantikan oleh nukleotida urasil. Sitosin bersebelahan dengan guanin. Berlawanan dengan adenin adalah urasil, dan berpasangan dengan timin adalah adenin. Molekul RNA yang dibalik ini disebut messenger RNA (mRNA). Mereka mampu keluar dari nukleus melalui pori-pori ke dalam sitoplasma dan ribosom, yang sebenarnya melakukan fungsi sintesis protein dalam sel.
Tentang kompleks dengan kata-kata sederhana
Sekarang rantai polipeptida protein dirangkai dari rangkaian asam amino. Transkripsi dapat disebut membaca informasi tentang protein masa depan dari cetakan DNA ke RNA. Ini dapat didefinisikan sebagai tahap pertama. Setelah RNA meninggalkan nukleus, ia harus melakukan perjalanan ke ribosom, tempat terjadinya langkah kedua, yang disebut translasi.
Translasi sudah merupakan transisi RNA, yaitu transfer informasi dari nukleotida ke molekul protein, ketika RNA memberi tahu urutan asam amino apa yang harus ada dalam suatu zat. Dalam urutan ini, messenger RNA memasuki sitoplasma ke ribosom, yang melakukan sintesis protein di dalam sel: A (adenin) - G (guanin) - U (urasil) - C (sitosin) - U (urasil) - A (adenin).
Mengapa ribosom dibutuhkan?
Agar translasi dapat terjadi dan sebagai hasilnya terbentuknya suatu protein, diperlukan komponen-komponen seperti messenger RNA itu sendiri, RNA transfer, dan ribosom sebagai “pabrik” tempat produksi protein tersebut. Dalam hal ini, ada dua jenis fungsi RNA: informasional, yang dibentuk dalam nukleus dengan DNA, dan transportasi. Molekul asam kedua tampak seperti semanggi. “Semanggi” ini menempelkan asam amino ke dirinya sendiri dan membawanya ke ribosom. Artinya, ia mengangkut senyawa organik langsung ke “pabrik” untuk pembentukannya.
Bagaimana rRNA bekerja
Ada juga RNA ribosom, yang merupakan bagian dari ribosom itu sendiri dan melakukan sintesis protein di dalam sel. Ternyata ribosom adalah struktur non-membran; mereka tidak memiliki membran, seperti nukleus atau retikulum endoplasma, namun hanya terdiri dari protein dan RNA ribosom. Apa yang terjadi jika rangkaian nukleotida, yaitu RNA pembawa pesan, sampai ke ribosom?
Transfer RNA, yang terletak di sitoplasma, menarik asam amino ke arah dirinya sendiri. Dari mana asal asam amino di dalam sel? Dan mereka terbentuk sebagai hasil pemecahan protein yang tertelan bersama makanan. Senyawa ini diangkut oleh aliran darah ke sel, tempat protein yang diperlukan tubuh diproduksi.
Tahap akhir sintesis protein dalam sel
Asam amino mengapung di sitoplasma seperti halnya RNA transfer, dan ketika rantai polipeptida dirakit secara langsung, RNA transfer ini mulai bergabung dengannya. Namun, tidak setiap urutan dan tidak setiap RNA transfer dapat bergabung dengan semua jenis asam amino. Ada situs spesifik tempat asam amino yang dibutuhkan dilekatkan. Bagian kedua dari RNA transfer disebut antikodon. Unsur ini terdiri dari tiga nukleotida yang saling melengkapi dengan urutan nukleotida pada messenger RNA. Satu asam amino membutuhkan tiga nukleotida. Misalnya, untuk mempermudah, protein tertentu hanya terdiri dari dua asam amino. Jelas terlihat bahwa protein umumnya memiliki struktur yang sangat panjang dan terdiri dari banyak asam amino. Rantai A - G - U disebut triplet, atau kodon, dan transfer RNA dalam bentuk semanggi akan melekat padanya, yang pada ujungnya akan terdapat asam amino tertentu. Triplet C - U - A berikutnya akan bergabung dengan tRNA lain, yang akan mengandung asam amino yang sama sekali berbeda, melengkapi urutan ini. Dalam urutan ini, perakitan rantai polipeptida lebih lanjut akan terjadi.
Signifikansi biologis dari sintesis
Ikatan peptida terbentuk antara dua asam amino yang terletak di ujung semanggi masing-masing triplet. Pada tahap ini, RNA transfer memasuki sitoplasma. Kembar tiga tersebut kemudian digabungkan dengan RNA transfer berikutnya dengan asam amino lain, yang membentuk rantai polipeptida dengan dua asam amino sebelumnya. Proses ini diulangi sampai urutan asam amino yang dibutuhkan tercapai. Dengan cara ini, sintesis protein terjadi di dalam sel, dan enzim, hormon, zat darah, dll terbentuk.Tidak setiap sel menghasilkan protein apa pun. Setiap sel dapat membuat protein tertentu. Misalnya, hemoglobin akan terbentuk di sel darah merah, dan sel pankreas akan mensintesis hormon dan berbagai enzim yang memecah makanan yang masuk ke dalam tubuh.
Protein aktin dan miosin akan terbentuk di otot. Seperti yang Anda lihat, proses sintesis protein dalam sel bersifat multi-tahap dan kompleks, yang menunjukkan pentingnya dan kebutuhannya bagi semua makhluk hidup.
Kemampuan sel untuk mempertahankan organisasi yang sangat teratur bergantung pada informasi genetik, yang diwujudkan, disimpan, direproduksi atau ditingkatkan melalui empat proses genetik: sintesis RNA dan protein, perbaikan DNA, replikasi DNA, dan rekombinasi genetik. Protein biasanya menyumbang lebih dari setengah massa kering sel, dan sintesisnya memainkan peran utama dalam proses seperti pertumbuhan dan diferensiasi sel, serta mempertahankan struktur dan fungsinya.
Tergantung pada aksi gabungan beberapa kelas molekul RNA. Pertama, sebagai hasil penyalinan DNA yang membawa informasi tentang protein yang disintesis, terbentuklah molekul messenger RNA (mRNA). Molekul RNA transfer (tRNA) spesifik melekat pada masing-masing dari 20 asam amino yang membentuk protein, dan beberapa faktor protein tambahan melekat pada subunit ribosom tempat sintesis terjadi.
Awal sintesis protein dalam sel dianggap saat komponen-komponen ini bergabung dalam sitoplasma untuk membentuk ribosom fungsional. Saat mRNA bergerak selangkah demi selangkah melalui ribosom, urutan nukleotidanya diterjemahkan (diangkut) ke dalam urutan asam amino yang sesuai, menghasilkan terciptanya rantai protein tertentu.
Sintesis RNA pada cetakan DNA disebut transkripsi. Sebagai hasil transkripsi, terbentuk molekul mRNA yang membawa informasi untuk sintesis protein di dalam sel, serta transpor, ribosom, dan jenis molekul RNA lainnya yang menjalankan fungsi struktural dan katalitik. Sintesis molekul RNA ini - salinan urutan nukleotida dari bagian molekul DNA - dikatalisis oleh enzim yang disebut RNA polimerase.
Pengikatan RNA polimerase menjadi sangat kuat jika RNA polimerase berikatan dengan urutan DNA tertentu, yang disebut promotor, yang berisi sinyal awal untuk sintesis RNA, yaitu ke tempat dari mana sintesis ini harus dimulai. Reaksi yang terjadi selanjutnya ditandai dengan hal berikut: setelah menempel pada promotor, RNA polimerase melepaskan bagian heliks gandanya, sehingga memperlihatkan nukleotida pada segmen pendek dari masing-masing dua untai DNA. Salah satu dari dua rantai terpisah ini harus menjadi cetakan untuk pasangan komplementer DNA utama dengan basa monomer yang masuk - ribonukleosida trifosfat. Polimerase menghubungkan dua monomer pertama yang masuk dan dengan demikian memulai rantai RNA yang disintesis. Kemudian RNA polimerase, bergerak selangkah demi selangkah di sepanjang DNA, melepaskan heliks DNA di depannya, setiap kali memperlihatkan bagian baru dari templat untuk pasangan basa komplementer. Dengan menambahkan satu nukleotida pada satu waktu ke rantai RNA yang sedang tumbuh, rantai tersebut secara bertahap meningkat.
Proses pemanjangan rantai RNA berlanjut hingga enzim bertemu dengan urutan nukleotida spesifik lain dalam rantai DNA dalam perjalanannya, yaitu sinyal penghentian transkripsi (stop signal). Setelah mencapai titik ini, polimerase terpisah dari DNA cetakan dan untai RNA yang baru disintesis. Saat enzim bergerak di sepanjang untai cetakan, heliks ganda RNA-DNA terbentuk di pusat aktifnya. Di belakang molekul polimerase, yang telah menyelesaikan tugasnya dalam sintesis DNA-RNA, heliks DNA-RNA segera dipulihkan, dan RNA dipindahkan. Setiap untai RNA yang lengkap dipisahkan dari cetakan DNA sebagai molekul untai tunggal bebas, yang jumlah nukleotidanya berkisar antara 70 hingga 10.000.
Sebagai aturan, salah satu untai DNA ditranskripsi. Manakah dari dua rantai yang akan ditranskripsi ditentukan oleh promotor, yang urutan nukleotidanya diorientasikan sedemikian rupa untuk mengarahkan RNA polimerase ke satu jalur atau lainnya.
Diketahui juga bahwa protein khusus yang mengatur aktivitas gen berperan penting dalam menentukan bagian DNA mana yang akan ditranskripsi oleh RNA polimerase. Pada merekalah protein apa yang akan diproduksi sel terutama bergantung. Selanjutnya pada sel eukariotik, sebagian besar transkrip RNA DNA akan meninggalkan inti sel dan berpindah ke sitoplasma dalam bentuk mRNA, mengalami perubahan yang signifikan – mengalami penyambungan.
Semua sel mengandung satu set RNA transfer (tRNA) - molekul kecil yang ukurannya berkisar antara 70 hingga 90 nukleotida. RNA ini, dengan menggabungkan salah satu ujung ke kodon mRNA tertentu dan ujung lainnya dengan menempelkan asam amino yang dikodekan oleh triplet ini, memungkinkan asam amino berbaris dalam urutan yang ditentukan oleh urutan nukleotida mRNA.
Setiap tRNA hanya dapat membawa satu dari 20 asam amino yang digunakan dalam sintesis protein. Transfer RNA yang mentransfer glisin ditetapkan sebagai Gly tRNA, dll. Ada satu jenis tRNA untuk masing-masing dari 20 asam amino. Setiap asam amino harus terikat secara kovalen ke tRNA yang mengandung antikodon yang benar - rangkaian tiga nukleotida yang melengkapi kodon tiga nukleotida yang mendefinisikan asam amino ini dalam molekul mRNA. Pasangan kodon-antikodon memungkinkan setiap asam amino dimasukkan ke dalam rantai protein yang sedang tumbuh sesuai urutan yang ditentukan oleh urutan nukleotida mRNA. Jadi kode genetik digunakan untuk menerjemahkan (menerjemahkan) rangkaian nukleotida asam nukleat menjadi rangkaian asam amino protein.
untai mRNA berwarna merah, ribosom berwarna biru, rantai polipeptida yang tumbuh berwarna hijau. (Foto oleh Dr Elena Kiseleva).
Dengan menggabungkan asam amino di satu ujung dan berpasangan dengan kodon di ujung lainnya, tRNA mengubah rangkaian nukleotida menjadi rangkaian asam amino. Fungsi tRNA bergantung pada struktur tiga dimensi molekulnya. Dimana tepatnya asam amino tertentu akan melekat pada rantai polipeptida yang sedang berkembang tidak bergantung pada asam amino itu sendiri, namun pada molekul tRNA yang mengikatnya. Molekul tRNA terikat secara kovalen pada asam amino tersebut, dari dua puluh asam amino, yang merupakan pasangan sebenarnya. Mekanisme ini dikaitkan dengan partisipasi enzim yang disebut sintase aminoasil-tRNA, yang menempelkan asam amino ke kumpulan molekul tRNA yang sesuai. Setiap asam amino memiliki sintetase khusus sendiri (total ada 20 sintetase seperti itu): yang satu menambahkan, misalnya, glisin ke tRNA Gly, yang lain menambahkan alanin ke tRNA Ala, dll. Dengan demikian, molekul tRNA berperan sebagai adaptor akhir, menerjemahkan informasi yang terkandung dalam urutan nukleotida asam nukleat ke dalam bahasa protein.
Reaksi sintesis protein memerlukan stimulus katalitik yang kompleks untuk terjadi. Ujung rantai polipeptida yang tumbuh harus disesuaikan dengan cara tertentu ke molekul mRNA agar setiap kodon mRNA berikutnya dapat terhubung secara akurat ke antikodon tRNA tanpa melewatkan satu nukleotida pun. Jika tidak, maka akan menyebabkan pergeseran urutan pembacaan.
Lebih dari separuh massa ribosom adalah RNA (rRNA), yang berperan peran kunci dalam aktivitas katalitik ribosom. Ada tiga situs berbeda di ribosom tempat RNA berikatan - satu untuk mRNA dan dua untuk tRNA. Dari dua daerah terakhir, satu daerah mengikat molekul tRNA ke ujung rantai polipeptida yang sedang tumbuh, sehingga disebut situs pengikatan peptidil-tRNA, atau situs P.
Bagian kedua berfungsi untuk menahan hanya molekul tRNA yang datang dan sarat dengan asam amino. Ini disebut situs pengikatan aminoasil-tRNA, atau situs A. Molekul tRNA terikat kuat pada kedua situs hanya jika antikodonnya berpasangan dengan kodon mRNA komplementernya. Situs A dan P terletak sangat dekat satu sama lain, sehingga dua molekul tRNA yang terkait berpasangan dengan dua kodon yang berdekatan dalam molekul mRNA.
Proses menumbuhkan rantai polipeptida pada ribosom dapat dianggap sebagai siklus yang terdiri dari tiga tahap terpisah:
- Molekul aminoasil-tRNA berikatan dengan situs bebas ribosom yang berdekatan dengan situs P yang ditempati. Pengikatan terjadi dengan memasangkan nukleotida antikodon dengan tiga nukleotida mRNA yang terletak di situs A.
- Pada tahap kedua, ujung karboksil rantai polipeptida di situs P dipisahkan dari molekul tRNA dan ikatan peptida terbentuk dengan asam amino yang melekat pada molekul tRNA di situs A.
- Peptidil tRNA baru ditransfer ke situs P ribosom, sedangkan ribosom bergerak sepanjang molekul mRNA tepat tiga nukleotida.
Proses translokasi, yang merupakan tahap ketiga, juga mencakup kembalinya molekul tRNA bebas yang dipisahkan dari rantai polipeptida di wilayah P selama tahap kedua kumpulan tRNA sitoplasma. Oleh karena itu, setelah tahap ketiga selesai, situs A yang kosong dapat menerima molekul tRNA baru yang diisi dengan asam amino lain, sehingga siklus dapat dimulai lagi.
Proses yang sangat intensif energi. Pembentukan setiap ikatan peptida baru disertai dengan susunan empat ikatan fosfat berenergi tinggi. Dua di antaranya digunakan untuk memuat molekul tRNA dengan asam amino, dan dua lagi digunakan untuk sintesis itu sendiri dalam siklus reaksi yang terjadi pada ribosom. Pada akhir siklus, peptidil transferase tidak mengikat asam amino, tetapi molekul H 2 O ke peptidil-tRNA, yang menyebabkan ujung karboksil dari rantai polipeptida yang sedang tumbuh dipisahkan dari molekul tRNA - rantai protein bebas dan memasuki sitoplasma.
Dengan demikian, sel yang baru terbentuk setelah pembelahan mitosis diberkahi dengan kesinambungan spesies materi herediter, sebagai hasil perpindahannya selama pembelahan dalam jumlah yang sama ke kedua sel anak. Sel anak melanjutkan proses metabolisme spesies yang ditetapkan secara evolusioner, memperoleh sifat-sifat yang khas dari populasi sel yang berasal dari jaringan. Oleh karena itu, dalam waktu singkat, sel-sel yang baru terbentuk mengalami spesialisasi (diferensiasi) sesuai dengan afiliasi utamanya yang ditetapkan secara genetik. Sejumlah sifat menjadi sangat umum pada semua sel, apa pun sistem jaringan tempat sel tersebut menjalankan siklus hidupnya. Untuk menjalankan fungsinya, sel diberkahi dengan sejumlah sifat yang sangat terspesialisasi.
Sumber:
Sitofisiologi / Lutsenko M.T. // Novosibirsk-Blagoveshchensk, 2011.